二月二十八日，巴塘丁宁寺堪布聚众3500余名，攻入城内，杀死巴塘都司吴以忠、委员秦宗藩，凤全的卫队也死伤惨重。

    二月二十九日，攻入凤全行辕，抢空军器、银物，焚尽档案、文卷。巴塘正土司罗进宝为脱干系，以便向川督交差，佯为出面解救，让凤全驻进自己的衙内，方使凤全暂免于难。此时，巴塘粮务试用知县吴锡珍也被围困在自己的公衙内，身边只有20人，无法去谒见凤全，后来只好求差房业主巴阿登前往土司寨内，代向凤全禀安，并恳请罗进宝设法劝散围攻群众。罗进宝以“限日离境、不得逗留”之条件同意解围。凤全势孤，被迫同意这城下之约。

    三月一日，凤全率余众60余人启程离开巴塘。吴锡珍在公衙楼上望见大批手持军器之藏众，紧跟在凤全的队伍后面，知事不妙，乃飞追而至，先执意拦马而不退，后复请求随行。凤全令其回衙戴上官帽，允许护送一程。吴锡珍佩带齐整时，凤全的队伍已远，未能跟上，侥幸成为这次事件中的幸存者。

    罗进宝的所谓谈判协议，实际上是陷害凤全的一个阴谋。凤全尚未出发，他们早已在必经之要隘处布下埋伏，这个要隘就在距巴塘五里程之鹦哥嘴，此处为峡谷，两侧地势陡峻，藏众垒石而待清兵至。当凤全一进入伏击区，先见垒石如骤雨而至，次闻吼声如雷鸣应山。凤全方知难避，未来得及作任何抵抗，就丧生在乱刀之下，随行人员亦无一生还。与凤全同时殉难的人员有：四川候补知县赵潼，四川另补知县王宣麟，四川驻防笔帖式维堃，贵州试用巡检陈式钰，五品军功何蕖臣，五品军功卫队管带李胜贵，外委戈什马鹏高、佟正凯，勇丁龙国安、晏鸿钧、萧盛鸿、吉云川、蒋训益、唐显耀、黄俊超、杨占魁、彭星五、李镇川、伍玉成、许翰屏、周贵廷、张占成、曾海清、郑秋明、唐占春、赵振声、刘镇川、郭炳忠、向占斛、青国治、邱焕章、蒲克胜、欧阳辉、欧阳均、杨辉武、陈义山、钟得云、彭兆荣、冯庆书、钟定国、龚占青、金安华、刘绍武、刘青云、沈定帮、黄永合、周国垣、刘华齐、周开科、张怀德、罗治国、唐星明、王祥云、王占武、胡定国、王火夫、秋火夫、家丁张福、叶贵、杨裁缝、张厨子、李厨子。

这便是清末川边轰动中外的“凤全事件”。它在客观上破坏了民族团结，干扰了改革进程，助长了分裂分子的破坏行为，阻碍了筹边援藏以固国防的大局，促使清政府下决心对川边加强管理并从事经营。史家称“凤全事件”是清末川边康区改土归流的“导火索”，由此拉开了赵尔丰在川边康区改土归流的序幕。